Luka Wanjohi là cộng sự quản lý kiến thức cấp cao trong khu vực tại Trung tâm Khoai tây Quốc tế ở Uganda và làm việc với dự án Cải tiến Di truyền Khoai lang và Hệ thống Hạt giống Sáng tạo (SweetGAINs). Ông đã nói chuyện với Chuyên gia Truyền thông Khu vực, Vivian Atakos về cách các số liệu thống kê thúc đẩy những đột phá trong nhân giống cây trồng bằng cách hợp lý hóa cách thu thập và chia sẻ thông tin.
Hỏi: Khi người ta nghĩ đến thống kê giống cây trồng và thu thập dữ liệu không nhất thiết là điều đầu tiên nghĩ đến. Quản lý dữ liệu đóng vai trò gì trong việc phát triển và áp dụng các giống cây trồng cải tiến?
LĐ: Dữ liệu có thể được coi là trung tâm và linh hồn của các hoạt động nghiên cứu. Sweet GAINs hoạt động ở các quốc gia khác nhau với các đối tác khác nhau, mọi người đều có cách thu thập dữ liệu và quản lý hoạt động nghiên cứu của mình theo cách khác nhau. Cần có các hoạt động quản lý dữ liệu phù hợp và rất chuẩn hóa để đảm bảo rằng chúng ta sẽ có thể thành công trong việc sử dụng dữ liệu để đưa ra các quyết định lựa chọn của mình. Các nhà tạo giống cây trồng dựa vào dữ liệu để đưa ra quyết định lựa chọn tốt. Trước khi một loạt sản phẩm được phát hành, chúng tôi muốn hiểu những gì chúng tôi đang thay thế. Tại sao chúng tôi cho rằng cần phải có một phiên bản giống mới ở một quốc gia.
Q: Những rủi ro của việc không hệ thống hóa dữ liệu được tạo ra bởi một chương trình chăn nuôi hiện đại là gì?
LĐ: Nếu chúng tôi không thu thập dữ liệu của mình và xác định các đặc điểm mà chúng tôi thu thập theo cách chuẩn hóa, thì chúng tôi sẽ khó chia sẻ dữ liệu. Bạn sẽ thấy rằng khi bạn không có cách quản lý dữ liệu của mình một cách có hệ thống, thì những người không ở đó khi dữ liệu đó được tạo, có thể gặp khó khăn khi làm việc với dữ liệu đó. Cuối cùng, không hệ thống hóa dữ liệu của bạn có nghĩa là bạn có nguy cơ mắc phải nhiều lỗi, mất dữ liệu hoặc thu thập dữ liệu bị hỏng. Điều này khiến bạn rất khó sử dụng dữ liệu này mà không thực hiện cái mà chúng tôi gọi là quản lý dữ liệu— một quá trình tốn kém và tẻ nhạt. Ngay cả sau khi quản lý, một số dữ liệu sẽ bị mất hoặc không sử dụng được.
Việc chuẩn hóa thu thập và quản lý dữ liệu giúp các nhà lai tạo giống cây trồng có thể dựa trên công trình của nhau. Trước đây, việc thu thập dữ liệu không được chuẩn hóa giữa các dự án và địa điểm khác nhau, dẫn đến hiểu sai hoặc mất thời gian đáng kể (ảnh: Isabel Corthier/).CIP)
H: Tại sao việc thực hiện Quy trình vận hành tiêu chuẩn để quản lý dữ liệu trong chọn giống cây trồng là quan trọng?
LĐ: Những lợi ích rõ ràng mà chúng tôi thấy liên quan đến việc thực hiện các Quy trình hoạt động tiêu chuẩn (SOP) này là chúng tôi có thể thiết lập các tiêu chuẩn rõ ràng cho dữ liệu chất lượng cao về cách chúng tôi thực hiện các thiết kế thử nghiệm của mình. Phương pháp số hóa của chúng tôi xử lý cách chúng tôi thu thập dữ liệu, những thiết bị cải tiến nào chúng tôi sử dụng, v.v. Lợi ích khác là chúng tôi đảm bảo dữ liệu chúng tôi thu thập là dữ liệu có thể so sánh được hôm nay và ngày mai trên các môi trường và quốc gia khác nhau, chúng tôi đang làm việc.
H: Những thách thức của việc không chuẩn hóa dữ liệu trong một chương trình là gì?
LĐ: Nếu chúng ta muốn thực hiện một phân tích chung trong tương lai, chúng ta cần các hệ thống đặt tên được tiêu chuẩn hóa. Để nói về một thử nghiệm nâng cao từ một thử nghiệm sơ bộ, chúng tôi sử dụng cùng một bản thể luận. Ví dụ, một thời gian trước, chúng tôi muốn xem xét mức độ ảnh hưởng của bệnh retrovirus trên cây khoai lang, nhưng đó là một thách thức vì trước đây một nhóm có thể chấm điểm trên thang điểm từ một đến năm, dựa trên mức độ nghiêm trọng của ảnh hưởng của một loại vi rút trên cây trồng. Sau đó, chúng tôi tìm thấy một chương trình khác được chấm theo thang điểm từ một đến ba, và một chương trình khác sẽ sử dụng hệ thống tính điểm từ một đến chín. Khi chúng ta nói về bản thể luận, chúng ta đang chuẩn hóa những điểm số này để chúng giống nhau trong các chương trình. Chúng tôi cũng sử dụng BreedBase để tập trung lưu trữ tất cả dữ liệu của mình và cho phép chúng tôi theo dõi dữ liệu thử nghiệm qua các lần chuyển đổi (chương trình) khác nhau và sớm phát hiện ra các vấn đề tiềm ẩn trong công việc thay vì phát hiện ra rằng chúng tôi đã thu thập hoặc lưu trữ dữ liệu sai ngay tại khi bạn muốn thực hiện một phân tích.
Q: Làm thế nào để thu thập và quản lý dữ liệu giúp các nhà chăn nuôi nhắm mục tiêu các đặc điểm ưa thích, hợp lý hóa công việc của họ và giảm chi phí tổng thể?
LĐ: Quy trình quản lý dữ liệu hiệu quả hỗ trợ nhà chăn nuôi thu thập dữ liệu nhanh chóng, tiết kiệm chi phí, cho phép họ thu thập nhiều dữ liệu, phân tích và đưa ra quyết định lựa chọn để hỗ trợ công việc của họ. Các nhà chăn nuôi thường làm việc với rất nhiều gia nhập. Tôi đã thấy các thử nghiệm ở Uganda, nơi một lô có khoảng 7000 mục trong một thử nghiệm có tới 7000 ô. Khi bạn có một số lượng lớn quyền truy cập, bạn muốn có thể truy cập, thu thập dữ liệu của mình một cách nhanh chóng và hiệu quả. Đưa vào một quy trình cho phép bạn thực hiện điều này bằng kỹ thuật số, tránh các mục nhập trên giấy có nguy cơ chuyển mã dữ liệu sai trong quá trình số hóa. Các công cụ của chúng tôi có kiểm tra tích hợp để đảm bảo chúng tôi đang thu thập đúng dữ liệu hoặc hạn chế việc nhập dữ liệu nhiều nhất có thể. Chỉ những giá trị cho phép mới có thể được thu thập. Điều này cho phép phân tích dữ liệu nhanh chóng vì nó đã được số hóa và dễ dàng chia sẻ nhanh chóng với đồng nghiệp và những người khác đang giúp phân tích dữ liệu.
H: Hãy cho chúng tôi biết về cách sử dụng mã vạch giúp hợp lý hóa thông tin.
LĐ: Chúng tôi đã sử dụng rất nhiều nhãn mã vạch trong một thời gian. Các chương trình được khuyến khích để đảm bảo rằng họ in nhãn cho các tài liệu của họ trong nhà máy và ngoài thực địa. Bản chất của nhãn mã vạch là có thể theo dõi chuyển động của một quyền truy cập nhất định hoặc một kiểu gen nhất định trên các lĩnh vực công việc khác nhau. BreedBase, cơ sở dữ liệu của chúng tôi, tạo ra một ID duy nhất cho mỗi lô đất mà bạn đưa ra trên thực địa và chúng tôi đặt ID này trên mã vạch, vì vậy chúng tôi có thể theo dõi hiệu suất của một mục nhập nhất định từ ruộng đến vụ thu hoạch và khi nào chúng tôi mang nó đến phòng thí nghiệm để phân tích, v.v.
Q: Bạn có lời khuyên nào cho các tổ chức khác đang tìm cách triển khai các quy trình vận hành tiêu chuẩn vào các chương trình chăn nuôi của họ?
LĐ: Chúng tôi đã biết rằng SOP của chúng tôi là một tài liệu sống. Cần phải có sự phát triển vì một khi bạn có một tài liệu tham khảo, mọi người sẽ dễ dàng quay lại và xem nó và hỗ trợ những người sống rải rác khắp nơi trong khu vực. Lời khuyên của tôi cho những người khác là sự phát triển nên là một phần của các hoạt động bạn đang làm ngày hôm nay. Bắt đầu nhỏ, ghi lại các thủ tục như ngày nay. Lặp lại với các nhóm chăn nuôi, với những người đang thực sự triển khai các hoạt động chăn nuôi và cố gắng liên tục cải tiến tài liệu này. Đừng nhắm đến việc chuẩn bị sẵn một tài liệu hoàn hảo. Bắt đầu bằng cách viết một và sau đó thông qua nỗ lực hợp tác của mọi người trong nhóm để nắm bắt tất cả các quy trình và tất cả các hoạt động thường xuyên trong chương trình chăn nuôi. Vì vậy, theo thời gian, bạn sẽ có một tài liệu bao trùm nhất có thể và ghi lại tất cả các hoạt động mà bạn đang thực hiện trong chương trình của mình.
Ghé thăm chúng tôi trên SoundCloud để nghe Podcast SweetGAINS có sự góp mặt của Luka Wanjohi và các nhà khoa học khác hiện đại hóa việc nhân giống cây trồng.
